Index

_

__getitem__() (genomedata.Chromosome method) (genomedata.Genome method) __init__() (genomedata.Genome method)

__iter__() (genomedata.Chromosome method) (genomedata.Genome method)

A

add_track_continuous() (genomedata.Genome method)

attrs (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Supercontig attribute)

C

Chromosome (class in genomedata) Chromosome.ChromosomeDirtyError

close() (genomedata.Chromosome method) (genomedata.Genome method) continuous (genomedata.Supercontig attribute)

D

default_mode (genomedata.Chromosome attribute)

default_where (genomedata.Chromosome attribute)

E

end (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Supercontig attribute)

erase_data() (genomedata.Genome method)

F

format_version (genomedata.Genome attribute)

G

Genome (class in genomedata)

genomedata (module)

I

index_continuous() (genomedata.Chromosome method) (genomedata.Genome method) isopen (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

itercontinuous() (genomedata.Chromosome method)

M

maxs (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute) means (genomedata.Genome attribute)

mins (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

N

name (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Supercontig attribute) num_datapoints (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

num_tracks_continuous (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

P

project() (genomedata.Supercontig method)

S

seq (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Supercontig attribute) start (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Supercontig attribute) sums (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

sums_squares (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute) Supercontig (class in genomedata) supercontigs (genomedata.Chromosome attribute)

T

tracknames_continuous (genomedata.Chromosome attribute) (genomedata.Genome attribute)

V

vars (genomedata.Genome attribute)