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| consensus | - | - | A | G | - | - | T | - | - | - | - | A | - | - | T | T | - | - | - | - | - | - | T | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | T | T | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | T | T | C | - | C | - | T | - | - | - | - |
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| Smik | T | T | G | A | A | T | A | A | T | T | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Skud | T | G | A | G | A | T | A | A | A | C | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | T | A | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||