Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spar     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     C G A T T G A T T A A C C A C A C C A G A T A T G C T T G G T G T A G C A G T A T A T A G C C C T T T T G G T G G T G C
Sbay     G G A C T G G T T G A C C A C G C C G G A T A T G C T T G G A G T G G C G G A G T A G A G C C C C T T T G G T G G C G C
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spar     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     A A T T T T C T T G T A C C T G C G G T A A A A A G G G A C G G A T A G A A C T G T T A G T A A A T G C T G A C T G T A
Sbay     A A T C T T C T T G T A C C T G T A G C G T A G C G T A A C G T A A C G G A G C G G T A G G G C T G T T A G T A A G C G
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spar     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G C G T G A A A A A C A T A C G A A A C A C A A A G G T C G G G C
Smik     T T C A T C C A A A T G A A A G A A A T C - - - - - - G T G T G G G A A A C A T A C G A A A C A C A G A G G T C C G G T
Sbay     G A T A T T C A C G T A A A T G A A G A G T G A G G G G C G A G G A A A A C A T A C G A A A C A C A A A G G T C T G G T
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T G T T T A G T T G A G G A - - - G G T A G - - - - - C A G C G G A G T A T
Spar     C T T G C A A C G T T A T T C A A A G T C A T A G T T A G A T G A G G G A C G G A C G G A C G G A C G G C G G C G T A T
Smik     C T T G C A A C G T T A T T C A A A G T C A T A T T T T A G C G G C G G - - - G A T T G A - - - - C A G C G G C T T C T
Sbay     C T T G C A A C G T T A T T C A A A G T C A T - - T T T G T T G G T G G - - - - - - - - - - - - - - A G G G G A A G C G
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T - - T T - - - - G - - G - - - - - - - - - - - - - - - - G - G G - - - - -
 
Scer     A T G T A T T C C T T T T T T T T G C C T A T G G A T G T T G T A C C A T G C C C A T T C T G C T C A A G C T T T T G T
Spar     T C G T A T T C C T T T T T T - - G T C T A T G G A A A T T G T G C T A T G C C T A T T C - A T T C A A G C T T T T G T
Smik     T C T T G T T C C T T T T T - - - G T C T T T G A A - A T T G A A T C A T C C T T A T T C - - A T C A A G C T T C T G T
Sbay     G C G T G T C T T G T C T C T - - A C C T T T G A A G T T C G T A A C A C G C C T G T T C - A T T C A A G G T T C T - T
consensus    - - - T - T - - - - T - T - - - - - - C T - T G - A - - T - G - - - - A - - C - - - T T C - - - T C A A G - T T - T - T
 
Scer     T A A A A T T A T T T T T C A G T - - A T T T T T T C - - - - - - T T C C A T G T T G C G C G T T A C G A - - G A A C A
Spar     C C A A A T T A T T T T C C A G T - - A T T T T T T - - - - - - - T T C C A T G T T G C G C G T T A C G A - - G G A C A
Smik     T C A G A T T A C T T T C C A C T G A A T T T T T T T T T T C G T T T T C A T G T T G T G C G C T A C G A A - G G A G G
Sbay     T T G A A T T G T T T T C C A A T - - A T T T T T T C T T T T - T T T T C A T G T T G C G C G C T A C G A G T G A A G A
consensus    - - - - A T T - - T T T - C A - T - - A T T T T T T - - - - - - - T T - C A T G T T G - G C G - T A C G A - - G - A - -
 
Scer     G A A G C G A C A G A T A A C C G C A A T C A T A C A A C T A G C G C T A C T G C G G G G T G T A A A A A G C A C A A G
Spar     G A G G C G A G A G A T A A C C A C A A T T A A T C A A T C A G C A C C A C A G C A G A G - G G A A G A A G C A C A A G
Smik     A A A G T G T G A A A T A A G C C C A A - - A C T C A T T A A T C A T C G C T A C C G A G - A G A A G A A G T A C A A G
Sbay     G C C A A G A T A A G A A A G A G C A A G C A A G C A A T C A A C C G T T C G T T C G T T A C C T A G T A A C G G G A G
consensus    - - - - - G - - A - - - A A - - - C A A - - A - - C A - - - A - C - - - - C - - - - G - - - - - - A - - A - - - - - A G
 
Scer     A A - C T A A G C C A A G A T C A C A A C A G - - - - - - T T A T C G A T A A A A T A G C - A G T G T T T G C A T G G C
Spar     A A - C T A A G C C A A G A T C A T A A C A G - - - - - - C T A T C G A T A C G A T A G C - G A T G T A T G - - - G G C
Smik     A A A C T A A A T C A A G A T T A T A A C A A A A A C A A T T A T C G A T A C A T T A A T G A A G G C G T G C A T A C C
Sbay     A A C A A G A A C A A G A A C A A G A A C A A - - - - - - G A G C C A A A G C A A T G G C T A G C A C - - - - - - G G C
consensus    A A - - - - A - - - A - - A - - A - A A C A - - - - - - - - - - - C - A - - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - C
 
Scer     C A T T G A G A A G G A C A A C A T T G G C G T G C G C G C C A A T G T T G T C T C A C C A T G T A G C T C C A A A - C
Spar     C A T T G A G A A A G A C A A T A T T G G C G T G C - C A A T A T T G T C T T T C T A A T G T G T A G C T C C A A A A T
Smik     C A T T C A T A C - - - T A A T G T T A A T G T T C - - - - - - - - G T C T C T A T C A T G - G T A T C T C C A A A C T
Sbay     C A C C A G C G - - - - - - - C A C T G A C C C G T - - - - - A G A A C A A T A A C G A C A C G C A G A T G T A C G C A
consensus    C A - - - - - - - - - - - - - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - A - - T - - A - - - -
 
Scer     G A G T T G T A A G - A G A C G G A C C G C T C - - - - A C G C T T C C G A A G C G G T C A G A - - A A A C G C T T C C
Spar     G A G A T T T C A G - A T A C G T A C C A A T T C G A A A A A G T G T G A G G G T T T T A A G C - - A A A C G T T T T T
Smik     G A C A C C T G A G - A T A C A G A C C C G - - - - - - A A A T T G T C T T - - C G G T C A A T - - A A G C G T T C T T
Sbay     C A C G C A T A C G C A T A C G C A C C C G G G - - - - C C T G C C T G T C A G C A G T C A G C C G A G G C G G G T G C
consensus    - A - - - - T - - G - A - A C - - A C C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T - A - - - - A - - C G - - - - -
 
Scer     C - A G T A T G C A G T T G - A C C T A C A T T - - - - - - C A A C C T G C A A A T A T - T G C T T T G C T T C - A A G
Spar     T T A G T A T G C A G T T G - A C C T A C A T C - - - - - - C A A G C T G T A A A T A A - A G C T C T A C T T T - G G G
Smik     T - G G C A C C T A G T C G T A C T T A C A C C A T G A G C C C A G C T A C T A A C A G - A C C C T C G C T C C T G A G
Sbay     A A G C C A A G C T T C T T C T T T T A C A C C - - - - - - - A C C T T G C A C T T A C C A C C T C C A C C T C T G T A
consensus    - - - - - A - - - - - - - - - - - - T A C A - - - - - - - - - - - - - T - - - - - - A - - - - C - - - - C - - - - - - -
 
Scer     A A A T G A T T A C A C A G A C G T C T A T T T T C T T - C T A C A T A A T G C A C G A A A C T T G G G C A T T T A G T
Spar     A A A T G A C T A C A C A G A G G T A C A T T T G A T - - C T A T A T T A A A C A C G A A A C T A G T G C A C T T A G T
Smik     T A A C G A C T A C A A A G G T G C A C C T T T T C T A T C T A T A T - A C A C A T T A A - T G T A T G C A C C T A G T
Sbay     T A C C A A G T A C A T A C G C A C C T - - - - - - - - - C C A T A T - A T A C A T A C A - C G T A C G C A T A T A G C
consensus    - A - - - A - T A C A - A - - - - - - - - - - - - - - - - C - A - A T - A - - C A - - - A - - - - - - G C A - - T A G -
 
Scer     C A - T G T A G C C G C C T A - - - - - G C G A G C C T G G G T G C C G T C C T A T C T C C T T T G T T C G T G C A A A
Spar     C A - T G T A G C C G C C T A - - - - - A C A A G C A C G G G C G C C G T C C T A T C T C C T T T G T T C G T G C C A A
Smik     C A A T G T A G C C G C C A A - - - - - A C G G G C G C G G G C G C C - C G T T C T C T C C T T T G T T C G T C C A A A
Sbay     G A - C A T A G C C G C C C A C G G C C A C G G A A C C G G G T C T G C T G C A A G A T C T T T T G T T C G T G C G A A
consensus    - A - - - T A G C C G C C - A - - - - - - C - - - - - - G G G - - - - - - - - - - - - T C - T T T G T T C G T - C - A A
 
Scer     G A G A C A G G A A C A C A C A C T G - - - C G T T C T C T T G C G G C C G G T C T G G C G G A C T C A G G G G T G C G
Spar     G G G A C A G G A A C A C A C A G T G - - - G G A T T T G T T G C G G C C G G T C T G G C G G T C T C A G G G G T G C G
Smik     G A G A C A G G A A C A C A C A T T A A - - T C T T T T G T C A C G G C C G G T C T G G C G G A C T C A G G A G T G C G
Sbay     G G G A C A G G C A C T C T C A C A A G C C G G T G C C G T C G C G G C C G G T C T A G C G G A C T C A G G G G T G C G
consensus    G - G A C A G G - A C - C - C A - - - - - - - - - - - - - T - - C G G C C G G T C T - G C G G - C T C A G G - G T G C G
 
Scer     G C G T T T G C T T A A C C G G A G G G A A T A A T A A A A T C G G G G T G A C G C A A G T A T G A A G T C A T G T G T
Spar     G C G T T T A C T T A A C C G G A G C G A A T A A T A A A A T C G G G G T G A C G C A A G G A T G A A G T C A T G T - T
Smik     G C G T T T G C T T A A T C G G A G G G G A T A A T A A A A T C T C G G T G A C A C A A G A A T G A A G T C A T A G A C
Sbay     G C G T T T G C T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C G A G G T G A T G C A A G C G T G A A G T C A T G G C G
consensus    G C G T T T - C T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C - - G G T G A - - C A A G - - T G A A G T C A T - - - -
 
Scer     G C T T A G C A A T T A C G T A G A G G G A T T A G A A A T A A T A G T G T G C G G T T A T C G G A A C - C G G C - T C
Spar     G G T T A G T G A T T A C G T A C G G A - - - C G G A A A G A A T A G T G T G C G G T T A T C G G A G C - C G G C - T C
Smik     - T C C A A C G A T T A C G T G C C G A C A - G G A A A A C C T T C G T G C G C G T T T A T C G G A G C - C G G T G T C
Sbay     T A A T G G C - A T T A C G T A G C A A A A A A G A A A A A G C A T G C G T G C G T T T A T C G G A G A G C G C T C T C
consensus    - - - - - - - - A T T A C G T - - - - - - - - - - - A A A - - - - - G - G - G C G - T T A T C G G A - - - C G - - - T C
 
Scer     T T G - T T C C C G T T T A G A G C A A C C C A G G T G C A G G C G T A C T T T A A A G T A T T T T - C T T T C T T T T
Spar     T T G - C T C C C G T T T A G G G C A A C T C G G G T G C A G G C G T G T T T T A A A G G C T T T T - C T T T C T T T T
Smik     T T A A C T T C C G T T T A A A G C A A T C C G G G T G C G G A C G T A C T G T G T G G T C T T T T A C T T T T T T T T
Sbay     T C T C T C T C T C T C T C T C T C T G C C C C T G T C C A G - C G C G C C C G G G T G C G G A T T T A T T A C T C A T
consensus    T - - - - - - C - - T - T - - - - C - - - - C - - G T - C - G - C G - - - - - - - - - G - - - - T T - - T T - - T - - T
 
Scer     T T T T C C T - - - - - - - - G C T A C T T A C G C T A G G A G C T G C C G C A G - - - - - - - - C T G C A A A G C C G
Spar     T T C - C C T - - - - - - - - C T T G C C C A T T C T G G G A G C T G C C G C A G - - - - - - - - C T G C A A A G C C G
Smik     T T C A T T T T T T T T C A A C C T G C T T G C G C C A G G A A C T G C C G C A G T G C C T C A G C T G C A A A G C C G
Sbay     G C T T T C T - - - - - - - - - - - - T T C T G G C C A G G G G C T G T T A C A G - - - - - - - - C T N C A N A N N C N
consensus    - - - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - C - - G G - - C T G - - - C A G - - - - - - - - C T - C A - A - - C -
 
Scer     A C G T C G G A G A G G C A G G T G A T C T T C G G C T C G G C C G A C A A A T C C C C T G G A T A T C A T T G G C C T
Spar     A C G T C G G A C A G G C A G G T G A T C T T C A G C T C G G C C G A C A A A T C C C C T G G A T A T C A T T G G C C C
Smik     A C G T C G G A C A G A T A G G C G A T C T T C G G C T C G G C C G A C A A A T C C C C T A G A T A C T A T T G G T C A
Sbay     A C N N C N G N N N N N N N N N C N N N N N N N C N N C C N N N N N A N N - - - N C N N N N N N N N T C A T T N N N C C
consensus    A C - - C - G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C - - - - - A - - - - - - C - - - - - - - - - - A T T - - - C -
 
Scer     G T C G A G G T A T C G G C - - - - - - - - C G C G T G G A A C T A C C G G G A A T T A C T A T G C A A A A C A A T T G
Spar     G T C G A G G T A T C G G C - - - - - - - - C G C C T G G A A C T A C C G G G A A T T A C C A C G C A G A - C A A T T G
Smik     G T C G A G G T A T C G G C - - - - - - - - C G C G T G G A A C T A C C G G G A A T T A C T A C A C A G A - C A A T T A
Sbay     G C T G A A G T A T C G G C G T A G T G T G C G C T T G G A A C T A C C G G G A A T T A G T G C A C A G A - C A A T T G
consensus    G - - G A - G T A T C G G C - - - - - - - - C G C - T G G A A C T A C C G G G A A T T A - - - - - C A - A - C A A T T -
 
Scer     - G A A A T C T G G T A G G A A A A - - - - C C T T G T T C T A G A A C T T G G C G A T T G C T G A C A A A G A A G A A
Spar     - G A A A T C T G G T A G G A A A - - - - - C C T T G T T C T A G A A C T T G G C G A T T G C T G A C A A A G A A G A A
Smik     - G A A A T T T G A T T G G A A A - - - - - C C T T G T T C T A G A A C T T G G C G A T T G C T G A C A A A G A A G A A
Sbay     A G A A A C C T G G C A A A A A A A A A A A C C T T G T T C T A G A A C T T G G C G A T T G C T G A C A A A G A A G G A
consensus    - G A A A - - T G - - - - - A A A - - - - - C C T T G T T C T A G A A C T T G G C G A T T G C T G A C A A A G A A G - A
 
Scer     A A G G G C C T A T T G T T G C T G C C T C T T T T G T T G T T C T T C C T C G T A T T G T C T T - G C C G G T G T T C
Spar     A A G G G C C T A T T G T T G C T G C C T C T T T T G T T G T T C T T C C A C G T A T T G T C T T - G C C G G T G T T C
Smik     A A G G G C C T A T T G T T G T T G C C T C T T T T G T T G T C T T T G C T - G T A T T G T T T T T G C C G G T G T T C
Sbay     A A G G G C C T A T T G T T G C T G C C T C T T T T G T T G T T C C T C - - - G T A T T G T T C T T G C T T G T A T T C
consensus    A A G G G C C T A T T G T T G - T G C C T C T T T T G T T G T - - - T - - - - G T A T T G T - - T - G C - - G T - T T C
 
Scer     T T T G T G T C T T T T G T G T G T A G G T T C T T A C T A T T A T A G T G C T C T T T G C T A T T A T A T T T T C T T
Spar     T T T G T G T C T T T T G C G T G C A G - T T T T T A C T G T T A T T G T G C T - T T C G C T A T T A T A T T T C A T T
Smik     C T T G T G T C T T T T G A G - G G A G G T T T G T A C T A T T A T T A T C G T T C T C G C T A T T A T A T T T T A T T
Sbay     - - - - - - - - T C T C G A G - - - - - - - T G C T A T T A T T - - T G T T G T A T T C G C T A T T A T A T T T - G T T
consensus    - - - - - - - - T - T - G - G - - - - - - - T - - T A - T - T T - - - - T - - T - - T - G C T A T T A T A T T T - - T T
 
Scer     C G T T T T C A C T T T G C G T A A T G T A A C G G T C - - - - - T T A A A C A A A G T T T T T T T T T T T T C G C T C
Spar     A G T T T T C A C T T T G C G T A A T G T A A C G G T C - - - - - C T A A A C A A A G T T T T T T T T T T T T C G C T C
Smik     C A T T T T C T C T T T G C G T A A T G T A A C G G T C - - - - - C T A A A C A A A G T T T G T T T T T T T T C G C T C
Sbay     C T T T T C T T G T T T G T G T A A C G T A A C G G T C G A A C A T C A A A C A A A G T T T T C T T T T T T T T T T T T
consensus    - - T T T - - - - T T T G - G T A A - G T A A C G G T C - - - - - - - A A A C A A A G T T T - - T T T T T T T - - - T -
 
Scer     T T G C A T T T T C C T T T T C T G C T C T A T C T T A T T T G C T A A T T G T A G T T T C A G A A G T T T T A C T T A
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Smik     T T G C A T T T T C C T T T T C T G T T C T C T C T T A T T T G C T A A C A G T A G T T T T A G A A T T T T T A C T T A
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consensus    - A - - T - - - - - - - - T T T - - A - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     C A T A T A - - - - - - - - - - - - - A T - T A T A C A T T T A C G G T G T C T T A - - - A C T C T C C C T C T T C A C
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consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     C C C T C A T T A T T C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C A G A A A A T A C T A A T A C T -
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consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - T C T T - - - - C A C A C A A A A G A A C G C A G T T A G A C A A T C A A C A
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Sbay     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -