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| consensus | T | A | - | A | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | T | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | - | T | - | - |
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| consensus | A | A | - | - | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | - | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | A | A | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | G | A | T | T | T | C | A | A | C | T | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | A | T | T | T | C | A | A | T | T | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | - | - | C | T | C | A | A | T | C | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | C | G | A | G | A | A | A | G | G | C | G | T | A | A | A | A | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | A | G | C | T | T | A | A | A | T | A | T | A | A | A | A | C | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||