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| consensus | A | G | A | T | A | A | A | A | A | - | - | T | T | T | T | T | - | - | C | A | - | C | T | G | C | - | - | T | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | T | T | G | - | - | A | - | - | C | T | - | A | C | C | T |
| Scer | A | T | T | T | G | T | T | A | C | A | T | A | A | A | T | T | T | C | G | T | T | A | T | T | T | T | G | C | A | C | T | T | G | T | T | A | C | C | C | A | T | C | G | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C | - | - | A | A | G | A |
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| Scer | A | A | C | C | A | A | G | A | A | C | C | A | A | T | A | T | C | C | T | C | A | T | T | A | A | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | A | A | C | C | A | A | G | A | A | C | C | A | A | T | A | T | C | C | T | C | A | T | T | A | A | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | A | A | C | C | A | A | G | A | A | C | A | A | A | T | A | T | C | C | T | C | A | T | T | A | A | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | A | A | C | C | A | A | G | A | A | C | C | A | A | T | A | A | A | C | T | C | A | T | C | A | A | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | A | A | C | C | A | A | G | A | A | C | - | A | A | T | A | - | - | C | T | C | A | T | - | A | A | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||