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| consensus | C | - | T | - | T | A | T | - | - | A | A | A | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | A | A | A | A | - | - | - | - | - | - | A | - | - | G | - | - | T | A | - | A | C | - | - | C | A | - | - | - | - | - | A | A | - | - | - | C | - | - |
| Scer | A | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Smik | A | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | G | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||