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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | A | T | A | T | G | T | T | T | T | T | A | A | A | C | C | A | A | A | A | T | T | C | G | G | C | T | C | C | T | T | T | T | C | C | C | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | A |
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| Smik | A | G | A | T | A | T | C | A | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sbay | A | G | A | T | A | T | C | A | A | T | A | T | G | A | A | T | A | A | - | A | G | A | A | T | A | A | A | G | T | A | T | T | A | A | G | C | C | A | T | G | T | T | G | G | T | T | C | T | T | A | C | T | A | G | G | T | T | A | C | G |
| consensus | A | G | A | T | A | T | C | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | C | T | A | G | G | G | C | A | T | T | T | C | T | G | A | A | G | C | T | T | T | A | C | G | T | A | T | C | A | C | T | A | G | A | G | A | A | G | T | T | A | T | T | T | T | G | G | C | A | |||||||||||
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| Smik | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||
| Sbay | T | T | G | A | A | G | T | G | T | C | G | G | T | A | A | A | G | G | T | T | T | T | G | G | T | A | C | T | - | T | C | A | A | A | G | A | A | G | A | C | A | A | A | T | C | G | A | G | A | |||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||