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| Smik | A | T | T | T | T | T | C | G | A | A | T | C | G | T | T | A | C | T | T | T | A | G | G | C | G | T | A | T | C | T | G | G | T | T | A | C | A | A | T | T | T | T | T | T | G | A | A | G | G | C | T | T | T | A | T | A | G | A | C | G |
| consensus | - | - | T | T | - | - | C | G | A | A | T | C | - | - | - | - | - | - | - | T | A | - | G | - | G | - | A | - | C | - | - | - | - | T | - | - | A | - | - | - | - | T | T | - | - | A | - | G | - | C | T | - | T | A | - | A | G | - | - | G |
| Scer | A | A | T | A | T | A | A | A | A | A | G | C | A | C | G | A | A | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | T | A | T | A | - | A | A | A | A | A | G | C | G | A | G | A | A | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | T | A | T | G | - | A | A | A | A | A | T | T | A | G | A | A | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | A | T | - | - | A | A | A | A | A | - | - | - | - | - | A | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||