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| consensus | - | - | T | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | A | - | - | T | - | - | - | - | T | T | - | - | - | A | - | T | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | - | - | A | - | - | - | - | C | A | - | C | - | - | C | - |
| Scer | G | T | T | A | G | G | - | T | T | A | T | A | C | C | G | A | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | G | T | C | A | G | C | - | T | T | A | T | A | T | T | G | G | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | G | T | T | A | G | T | - | T | C | A | T | A | T | G | G | G | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | A | T | T | T | G | T | G | C | T | A | T | A | C | A | G | A | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | T | - | - | G | - | - | - | - | A | T | A | - | - | G | - | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||