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| consensus | - | - | - | A | A | - | - | A | A | A | - | - | G | C | - | A | - | - | T | G | T | A | T | A | T | T | - | - | A | - | - | A | - | A | - | A | - | T | G | - | A | - | T | A | C | - | T | A | - | - | - | T | A | - | - | T | A | G | A | - |
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| consensus | G | A | G | A | - | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | A | T | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | T | T | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | T | T | T | G | A | T | T | T | G | A | T | A | T | C | A | - | - | - | - | - | - | A | G | A | T | C | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T |
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| consensus | - | T | T | - | - | - | - | T | G | - | T | A | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T |
| Scer | C | T | G | G | A | G | T | C | A | A | T | G | C | G | A | T | - | G | A | A | C | C | T | A | A | A | - | - | - | A | A | A | A | T | C | A | C | A | A | G | C | T | T | T | T | T | T | T | A | T | C | T | C | T | A | A | G | C | T | G |
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| consensus | - | T | - | - | A | - | - | - | - | A | T | - | - | - | A | T | - | G | - | A | - | C | T | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | A | - | C | T | - | - | - | A | - | - | T | - |
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| consensus | - | - | - | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | A | - | A | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | C | T | T | T | T | G | C | A | T | A | G | C | C | C | A | T | C | C | T | T | G | T | A | C | T | A | G | A | T | T | T | C | A | T | A | A | A | C | A | T | T | G | A | T | C | A | C | T | T | C | A | A | A | - | A | - | T | A | T | A |
| Spar | G | T | T | T | T | G | T | A | T | A | - | C | C | C | A | T | T | C | T | A | G | T | A | T | T | A | G | A | T | T | T | C | A | T | A | A | C | C | A | C | C | G | A | C | C | A | C | T | T | C | A | A | A | - | A | A | T | A | T | A |
| Smik | T | T | T | T | T | G | T | A | T | A | C | T | C | C | A | T | C | C | T | G | G | G | A | T | C | G | A | A | T | T | T | C | A | T | A | A | T | T | A | C | A | G | A | A | C | A | A | C | A | T | A | A | A | T | A | G | T | T | T | A |
| Sbay | G | N | N | T | T | N | N | A | N | N | T | N | N | T | A | N | T | T | T | N | N | A | N | T | N | N | N | A | N | N | N | C | A | N | A | N | C | C | N | N | N | T | N | A | N | N | C | A | N | N | N | N | A | - | - | - | N | A | N | N |
| Skud | C | T | T | T | T | T | C | A | T | A | T | C | C | T | A | T | T | C | T | A | G | A | G | T | T | A | A | A | A | T | T | G | A | T | A | A | C | C | A | A | T | T | T | C | A | A | A | C | C | A | T | A | A | - | - | - | - | A | T | A |
| consensus | - | - | - | T | T | - | - | A | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | A | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | C | T | T | G | T | A | C | C | A | A | G | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | T | T | G | T | G | C | C | A | A | C | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | T | T | T | G | C | G | T | T | A | A | A | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | N | G | N | A | T | N | T | N | A | A | A | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | C | C | C | A | C | C | T | C | A | A | A | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | A | A | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||