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| consensus | T | A | A | A | C | T | T | T | T | - | - | - | - | - | - | - | T | - | T | C | - | - | T | G | C | - | A | A | A | T | T | G | G | T | G | T | C | T | T | - | T | T | T | - | T | T | - | T | T | - | C | C | A | - | G | - | G | G | C | G |
| Scer | G | G | T | A | - | C | T | A | G | A | T | A | G | T | C | A | C | G | T | G | A | A | T | G | T | A | T | A | C | A | C | G | T | G | A | C | C | C | T | - | A | - | A | T | G | C | T | C | T | T | T | G | A | A | A | A | A | T | T | T |
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| Skud | T | C | T | - | G | T | G | A | A | A | A | G | T | T | G | C | C | A | T | A | A | T | A | C | A | G | G | A | A | A | A | A | G | C | T | G | A | C | G | A | T | T | G | T | C | T | T | T | T | A | A | A | - | T | T | T | G | T | A | G |
| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | T | A | - | - | A | - | - | - | - | A | - | - | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Scer | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | T | G | C | G | T | A | A | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | T | C | G | T | G | T | C | A | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | C | T | G | T | T | T | C | G | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||