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| consensus | A | - | - | - | - | - | - | - | T | - | G | G | - | - | A | A | A | - | G | - | A | - | A | G | T | - | - | - | T | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | - | - | - | A | - | - | - | G | T | - | - | T | - | A | G |
| Scer | A | G | C | A | G | T | G | A | - | - | A | G | T | T | T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | A | G | C | A | G | T | G | A | - | - | A | G | T | T | T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | A | G | C | A | G | C | C | A | G | T | A | G | C | T | T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | A | G | T | G | G | T | G | A | A | T | A | A | T | C | T | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | A | G | - | - | G | - | - | A | - | - | A | - | - | - | T | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||