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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | T | G | T | T | T | C | A | T |
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| Scer | G | G | T | A | T | T | G | A | A | T | A | A | T | T | A | T | A | A | T | T | A | T | A | C | C | A | A | T | A | A | A | A | - | - | T | T | A | A | C | A | A | A | T | A | G | T | T | A | G | C | A | T | C | A | G | G | G | A | A | T |
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| consensus | - | G | - | A | - | T | - | A | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | T | - | - | A | - | C | - | - | - | A | - | A | - | - | - | T | T | - | - | C | A | - | A | - | A | G | - | T | - | G | C | - | - | C | - | G | - | - | - | A | - |
| Scer | T | T | G | T | A | T | T | T | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | T | G | C | A | T | T | T | T | G | T | A | A | C | G | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | T | A | A | T | T | T | T | A | G | T | G | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | C | C | A | C | A | T | T | T | G | C | G | A | T | A | A | T | T | A | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | - | T | T | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||