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| Smik | G | T | C | A | A | A | T | T | T | G | T | C | T | G | C | T | A | C | C | G | T | C | G | C | T | C | A | G | G | T | A | T | C | C | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | - | C | T | A | T | C | A | T | C | A | C | A | - | - | - |
| Sbay | A | T | - | A | T | A | C | C | A | G | C | T | C | G | C | C | - | C | A | G | G | C | A | C | C | C | A | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | T | C | T | - | - | C | G | T | C | C | A | C | A | - | - | - | - | - |
| consensus | - | T | - | A | - | A | - | - | - | G | - | - | - | G | C | - | - | C | - | - | - | C | - | - | - | C | A | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | T | - | C | T | - | T | - | - | - | - | - | - | T | C | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Scer | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||