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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | T | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Scer | G | T | A | A | T | T | C | C | T | A | A | G | C | T | T | T | T | C | C | A | C | A | A | C | C | T | T | G | C | T | T | G | C | T | A | A | A | T | A | T | - | T | C | T | A | A | C | A | T | G | T | C | A | C | T | A | A | A | G | T |
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| Smik | A | T | A | A | T | C | C | T | T | A | A | T | C | T | C | T | T | C | C | T | C | G | T | C | C | A | T | G | C | T | T | G | C | T | A | A | A | T | A | T | - | G | C | T | A | A | A | A | T | G | T | C | A | C | T | A | T | T | A | T |
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| Skud | A | T | A | A | T | T | C | T | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | A | C | G | T | C | C | G | T | G | C | T | T | G | C | T | A | C | A | T | A | T | - | G | C | C | A | A | A | A | T | G | T | C | A | C | T | A | A | A | G | T |
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| consensus | T | - | - | - | - | G | T | T | T | T | - | - | C | C | C | T | T | T | T | - | G | G | - | A | A | - | G | T | A | A | T | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | C | A | C | G | T | G | - | - | - | T | G | C | G | G | G | T | A |
| Scer | A | T | G | G | A | G | A | G | G | T | - | T | T | T | T | T | A | A | A | A | T | T | T | T | T | C | A | A | T | T | T | T | G | T | T | C | A | A | G | G | A | A | G | - | A | A | T | A | T | G | G | C | A | A | A | A | - | - | C | A |
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| consensus | - | A | A | G | A | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | T | - | - | A | - | G | A | A | G | A | G | A | T | G | - | A | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | G | - |
| Scer | C | T | - | - | - | - | - | - | - | - | G | T | T | A | A | G | T | T | C | T | G | G | - | G | C | C | T | G | A | A | T | A | - | - | T | T | T | T | G | - | - | - | - | - | - | - | A | A | C | G | T | T | A | A | A | A | T | A | A | T |
| Spar | T | T | - | - | - | - | - | - | - | - | A | T | T | A | C | C | G | T | C | T | G | A | - | G | C | C | T | A | C | A | T | A | - | - | T | T | T | T | G | - | - | - | - | - | - | - | A | G | A | A | A | T | A | C | A | G | T | A | A | T |
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| Sbay | C | G | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | A | A | C | G | T | T | C | A | A | - | G | T | T | T | G | G | G | T | A | A | A | T | T | T | G | T | A | A | A | A | T | A | A | A | T | C | T | C | T | A | C | A | A | G | A | A | T |
| Skud | C | T | T | T | C | T | T | T | T | T | A | T | T | G | A | A | A | T | C | T | G | G | A | G | C | T | T | G | A | A | T | A | - | - | T | T | T | A | A | T | A | T | T | T | G | T | A | T | C | T | C | T | A | C | A | A | G | A | A | T |
| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | T | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | T | A | - | - | - | - | A | - | T |
| Scer | T | G | A | G | T | A | A | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | T | G | A | G | T | A | G | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | T | G | A | G | T | A | G | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | T | G | A | G | T | A | G | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | T | A | G | G | T | A | G | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | T | - | - | G | T | A | - | A | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||