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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | C | T | T | - | C | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | T | T | A | T | T | C | - | A | - | A | C | - | - | C | G | G | - | - | A | C | C |
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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | A | - | - | C | - | - | - | - | T | - | - | - | - |
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| consensus | - | - | T | T | T | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | T | - | - | - | - | T | T | - | A | - | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | A | A | - |
| Scer | C | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | C | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | A | C | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||