Scer     C T T G T T G C T T A T T C T C T T G C T G T A T T T - T T C G A A A C A C T G C T A A A T A A A A A G G T A T A T A T
Smik     T C T T G T G C T T A T T C T C T T G C T G T A C T T A T T C A G A A T A T T A C T A G A A A A A A A G G T A T A C A C
Skud.1     - - - - - - - - T T A T T C T C T T G C T G T G C T T G T T C G A A A T A T T A C T T A A T G A A A G G G T A T A T A G
consensus    - - - - - - - - T T A T T C T C T T G C T G T - - T T - T T C - - A A - A - T - C T - - A - - A A A - G G T A T A - A -
 
Scer     T A A A T A G T C T A C - T G C G T A A C C T A T A C A T T T T A C A T G G C A T T T A C T T T T G A C T T T - G C C A
Smik     T A A T T A C T G T G C - T G C G T A A C C T A T A C A T T T T A C A T C A C A C A T A C C T T T G A C C T T - G C A A
Skud.1     T A A A T A T A C T G C G T G A C T G A C C T A T A C A T T T T A C - - - G C A T T T A C T T T T G G T T T T T G T C A
consensus    T A A - T A - - - T - C - T G - - T - A C C T A T A C A T T T T A C - - - - C A - - T A C - T T T G - - - T T - G - - A
 
Scer     G T G T T A C T C T C T G C G C T A G - - - - G A T A A T A T T C G G T G G T A T A G G C T C A C G C G G C C T G G C C
Smik     G T G C T A C T C T C T G G G C C A C T A C A A C T G T C C A T C G A T A G T C T A G G C T C A T G C A G C C T C T C T
Skud.1     G C G T T G T T C C C C A A G C - A C - - - - G C T G T C C T T C C A C A T T C C A A G C T A A T C C A G C T T A G C C
consensus    G - G - T - - T C - C - - - G C - A - - - - - - - T - - - - - T C - - - - - T - - A - G C T - A - - C - G C - T - - C -
 
Scer     G G A A C G A A C T G C T - A C C A G T T C T G T T T C C C T C A G C T A G A G G G A A A C A G A G A G A A T T T C C G
Smik     G G A G C A T A C A G C T - G T C A G T A G T G T C T T T C C T T A - C A G C A G T A A C A G G C A G T A A G C T T C G
Skud.1     G G A C C G G A G A A C C C G C C G G T G A T A T T T G C T C C A G - T A G G A A C A A A C A A T A A T G - - C C C A G
consensus    G G A - C - - A - - - C - - - - C - G T - - T - T - T - - - - - - - - - A G - - - - A A - - - - - - - - - - - - - - - G
 
Scer     C C C A G G T C A A A G G C C - A C A G C A T C C T T C T A G A G G A G G A G C G A C A A C C T A A G G A A A A T T C A
Smik     C C T A C G A - A A A G G C G - - - - - - - A C G T C C T A G A G G G A A A G A A G C C G C C T - - G G A A A A C T T A
Skud.1     C C T A T G A G G A A A G C G G A C C T C C C C C C T C T A G A G G G A G A C T G C T C C C C T - - G A A A A A C T A A
consensus    C C - A - G - - - A A - G C - - - - - - - - - C - - - C T A G A G G - - - A - - - - - - - C C T - - G - A A A A - T - A
 
Scer     G T T T T T C C T A G A - - - - - T C G C A T A C A T T T T T C A A C C A C T T T T T T T C A C A A T G C A T T A T T T
Smik     A C T G C T C C T T G G T A T G C A A G C A T T N N N N N G A N C A T T N T T T T N N C N N N C A N N N N N N N A N N N
Skud.1     A C T T T T C G T A G G A A T C C T C A C G C T T G C T T T T T C A C A A T A T T A T T T C T A G G C C G A A A G A T T
consensus    - - T - - T C - T - G - - - - - - - - - C - - - - - - - - - - - - A - - - - - T T - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     T T C A A C A T G T A T G G G T G T T T T T T C T G A A T A T C A G A C T C T T T T A T G G A G T A A A A C A A G C T A
Smik     N N N A N N A N N T N N N N N N G T T T T N N N N N N N N N T G N N A N T N T N N N A N N N N N N N N A A C N N N N T A
Skud.1     T C C T A C A T G T A T G G G T G T T T T C A C A A A A G G T A A C C A T C T A A C A G T G A G - A A A A G A G G A T A
consensus    - - - - - - A - - T - - - - - - G T T T T - - - - - - - - - T - - - - - T - T - - - A - - - - - - - - A A - - - - - T A
 
Scer     T T A A T A T G T G A C C C A T A C A T T T C C T G T T A C A T C C T T A C A T A T A T - G C A G G C A A T T T T T T G
Smik     N N N N T N N N N N A N C N A N N N N T N T N N N N N N N N A N N N T N N N N N N N N C - N C N N N C A N N N N N T T N
Skud.1     A T G C T G T T A C A C C C A A C C A T T T C A A A C T A C A C C T T T A C A T T T G G A G C G G G C A A T T A T T T -
consensus    - - - - T - - - - - A - C - A - - - - T - T - - - - - - - - A - - - T - - - - - - - - - - - C - - - C A - - - - - T T -
 
Scer     T A G T T - - A G A A A A T T T A A T T T T T T T C T A G T C G G A A T A A T C A C A G T A G A G G T G T G G - A A A T
Smik     N N N N T G N N N N N A N N T N N N N N N N N N T T N N N N N G N A N T A N N N A N A A N A N A N N T N N N G A A A N N
Skud.1     T G G T T - - A G A A G T T T T C C A A T C T T T T T G A T C G G A A T A A T C A C A A C A A A C G T G C G G T A A A T
consensus    - - - - T - - - - - - - - - T - - - - - - - - - T - - - - - - G - A - T A - - - A - A - - A - A - - T - - - G - A A - -
 
Scer     C T T G G A A - - - A A T T T G A A A T G A T C G G A T A T T A G C T A C T A A T C C A T T T A A G C T T G C A G C A T
Smik     N N N N A A N C T N N N N N T G A A A N N N N G N A A T A N T A G C T A T T A T C - - A G T T C A G C T T G C A G G A T
Skud.1     T T T G A A A - - - A A T T T C A A T T A G C T A G A T A T T A G C T A T T A A T A - A T C A T A G C T T G C A G C A C
consensus    - - - - - A - - - - - - - - T - A A - - - - - - - - A T A - T A G C T A - T A - - - - A - - - - A G C T T G C A G - A -
 
Scer     T C T G T T C G A A G G G G T T T G A G A A A A G C A T A G T A C A G C A C A G C A G G A A T C G T A C A C A - - - - -
Smik     T T T C T T G C A A A G G C C C T G A A A A A A G C A C A G C A C A G C A C A G C A G G A A T C G T A C A C A A T G G G
Skud.1     T T T C C C A A T A G A G G T T T G A G C A A A G C A C A G C A C A G T A C A C C A G T A A T A A T A C A C A A T G G G
consensus    T - T - - - - - - A - - G - - - T G A - - A A A G C A - A G - A C A G - A C A - C A G - A A T - - T A C A C A - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     T A T G T C C A A T A T A A A A A G A A A T A G A A T T G C T T T G T C A T A T T A T A A A C A A T G A A G G C T C A C
Skud.1     T A T G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     T T G A A A C C A A A T A A A T G T C C C G T T G A G A G G C A T G C G A A T C A C A A C A T A T T A T T G A T G G A T
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     T C C A G A G A G G G C A A T A T T A C G C C A T T T A A C A C A G A G A A T T C A T C T T C A T T T T A C A C T A T T
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     T G A G G A G T T C T A A T A C T T T A T A G G T T A C T T T G G A A A T A C A T G A T T A T T T T G T C A C C A C T C
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     C A G G T T G C T G G C C T T C A A G T G T T C T T A G A T A A T A T G A T A A A C A C G G T G G T T G A T G T T A G A
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     A A T T G A T T A T T T G T T T A C T A A C A A T T A T T T A A T A T A A T T T A C C A A T T G G A T C A T A T T A G C
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     C A T T T C C A A G A A T T T A C C A A T C T T A A A G A A T C A T T T T A G A A A G C A C T G G C A A G A A C G T G T
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     C A A G G T G C A C T T T G A C C A A G C C G G T A A G A A G G T T T C T A G A C G T A A T G C T A G A G C T T C C A A
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     G G C T G C C A A A A T T G C C C C A A G A C C A T T A G A C C T T T T G A G A C C T G T T G T C A G A G C T C C A A C
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     T G T C A A G T A C A A C A G A A A G G T C A G A G C T G G T A G A G G T T T C A C C T T G G C T G A A G T T A A G G C
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     C G C T G G T T T G A C T G C T G C A T A C G C C A G A A C C A T T G G T A T T G C T G T T G A C C A C A G A C G T C A
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Smik     A A A C A G A A A C C A A G A A A T C T T C G A C G C T A A T G T C C A A A G A T T A A A G G A A T A C C A A T C C A A
Skud.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
Scer     - - - - - - - - - - -
Smik     G A T C A T T G T T T
Skud.1     - - - - - - - - - - -
consensus    - - - - - - - - - - -