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| consensus | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | A | T | T | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | T | A | - | - | - | - | - | A | - | T | - | G | - | - | - | T |
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| Skud | T | T | T | G | A | G | A | A | A | G | G | A | A | G | G | A | T | T | T | C | A | A | T | T | A | A | T | A | T | A | T | A | A | G | G | A | A | A | T | G | A | T | T | G | C | C | A | C | G | C | A | C | A | T | A | T | A | T | A | T |
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| Scer | C | A | T | A | A | G | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | A | T | A | A | G | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | A | T | A | A | G | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | A | A | T | A | G | G | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| consensus | - | A | T | A | - | G | - | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||