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| Smik | T | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | A | T | C | - | A | A | A | A | T | T | G | A | T | A | A | T | A | G | A | T | C | G | A | A | A | A | A | C | A | C | A | A | G | C | T | T | C | A | A | A | C | A | A | G | A |
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| consensus | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | A | A | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | A | - | C | - | - | A | A | A | - | C | - | - | - | A | - | - | - | T | - | A | A | - | - | A | A | - | A |
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| consensus | G | - | - | - | - | A | - | C | - | - | T | C | - | - | - | - | - | A | T | A | A | - | A | T | A | A | C | A | A | T | T | - | - | A | - | A | - | C | - | - | - | A | A | - | - | - | - | C | - | - | - | - | A | - | A | - | T | - | G | A |
| Scer | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spar | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Smik | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sbay | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Skud | T | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| consensus | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||